Genom paling lengkap namun untuk marsupial yang benar-benar unik - harimau Tasmania - menunjukkan bahwa, jika harimau tidak diburu hingga punah, mereka mungkin masih berjuang untuk bertahan hidup.
Macan Tasmania adalah marsupial karnivora terbesar yang diketahui pada zaman modern, sekitar ukuran anjing sedang-besar. Mereka diyakini telah punah di abad ke-20. Foto melalui Museum dan Galeri Seni Tasmania.
Oleh Nerissa Hannink, Universitas Melbourne. Pertama kali diterbitkan pada 12 Desember 2017 di Science Matters, UM.
Mengambang dalam botol kecil alkohol duduk di salah satu spesimen paling langka di Australia.
Guci, berlabel nomor koleksi C5757, berisi harimau Tasmania muda atau harimau Tasmania, salah satu spesies punah yang paling terpelihara, yang sekarang disimpan di Museum Victoria's Collection di Melbourne.
Ketika hewan itu menjadi lebih langka, museum di mana-mana memanjat untuk memiliki harimau Tasmania yang dipamerkan, dan mereka sekarang menjadi tempat perlindungan terakhir setelah diburu hingga punah pada tahun 1936.
Menggunakan teknik yang tidak pernah dibayangkan ketika harimau Tasmania terakhir mati di Kebun Binatang Hobart abad lalu, sebuah tim yang dipimpin oleh Universitas Melbourne kini telah mengurutkan genom harimau Tasmania (Thylacinus cynocephalus), menjadikannya salah satu blues genetik paling lengkap untuk hewan yang punah. .
Harimau Tasmania memiliki kantong perut, seperti kanguru. Mereka asli ke benua Australia, Tasmania dan Papua. Sekuensing genom kini telah terungkap bahwa spesies tersebut memiliki keanekaragaman genetik yang rendah. Foto melalui Museum dan Galeri Seni Tasmania.
Bagi pemimpin proyek Andrew Pask, harimau Tasmania adalah hasil kerja cintanya. Lebih dari 10 tahun yang lalu, ia dan tim internasional pertama kali membangkitkan gen harimau Tasmania dari kulit yang diawetkan, tetapi DNA terlalu terfragmentasi untuk mendapatkan seluruh genom.
Jadi, mereka mencari basis data di seluruh dunia museum dan menemukan spesimen C5757 dalam koleksi Museum Victoria - seekor anak harimau Tasmania yang masih muda. Karena harimau Tasmania adalah marsupial, yang merupakan mamalia dengan kantung, spesimen anak anjing ini dapat dilestarikan secara keseluruhan, memungkinkan tim peneliti untuk mengekstraksi DNA dan menggunakan teknik canggih untuk mengurutkan genom harimau Tasmania.
Andrew Pask mengatakan, hasilnya memberikan biru genetik penuh pertama dari predator puncak terbesar Australia untuk bertahan hidup di era modern. Dia berkata:
Genom memungkinkan kita untuk mengkonfirmasi tempat harimau Tasmania di pohon evolusi. Macan Tasmania termasuk dalam garis keturunan saudara perempuan dari Dasyuridae, keluarga yang mencakup Iblis Tasmania dan dunnart.
Yang penting, genom itu juga mengungkapkan kesehatan genetik yang buruk, atau keragaman genetik yang rendah, yang dialami harimau Tasmania sebelum diburu berlebihan. Setan Tasmania kini juga menghadapi 'kemacetan genetik' yang kemungkinan merupakan akibat isolasi genetik mereka dari daratan Australia selama 10.000 hingga 13.000 tahun terakhir.
Namun, analisis genom menunjukkan bahwa kedua binatang itu mengalami keragaman genetik yang rendah sebelum mereka menjadi terisolasi di Tasmania. Ini, pada gilirannya, menunjukkan bahwa harimau Tasmania mungkin menghadapi masalah lingkungan yang serupa dengan Iblis, seandainya mereka selamat, seperti kesulitan mengatasi penyakit. Pask berkomentar:
Harapan kami adalah ada banyak hal yang bisa diberitahukan harimau Tasmania tentang dasar genetik kepunahan untuk membantu spesies lain.
Harimau Tasmania terakhir mati di penangkaran pada tahun 1936. Foto melalui Museum dan Galeri Seni Tasmania.
Dia berkata:
Karena genom ini adalah salah satu yang paling lengkap untuk spesies yang punah, secara teknis ini adalah langkah pertama untuk 'mengembalikan harimau Tasmania,' tetapi kami masih jauh dari kemungkinan itu.
Kita masih perlu mengembangkan model hewan berkantung untuk menjadi tuan rumah genom harimau Tasmania, seperti pekerjaan yang dilakukan untuk memasukkan gen mammoth dalam gajah modern. Tetapi mengetahui bahwa harimau Tasmania menghadapi keanekaragaman genetik yang terbatas sebelum punah berarti bahwa ia masih akan berjuang seperti halnya Iblis Tasmania jika ia masih hidup.
Genom memberikan wawasan baru penting lainnya ke dalam biologi marsupial yang benar-benar unik ini.
Harimau Tasmania sering digambarkan sebagai anjing panjang dengan garis-garis, karena memiliki ekor yang panjang, kaku dan kepala besar. Tylacine yang sudah dewasa dapat mencapai 180 cm dari ujung hidung ke ujung ekor dan tingginya mencapai 23 cm (58 cm).
Garis-garis hitam tebal memanjang dari bahu ke pangkal ekor.
Seperti dingo, harimau Tasmania adalah binatang yang sangat pendiam. Tetapi mereka dilaporkan sebagai pemburu tanpa henti yang mengejar mangsa mereka sampai habis.
Para ilmuwan menganggap harimau Tasmania dan dingo sebagai salah satu contoh terbaik dari evolusi konvergen, proses di mana organisme yang tidak terkait erat berevolusi secara independen agar terlihat sama karena harus beradaptasi dengan lingkungan yang sama atau ceruk ekologis.
Tampaknya karena teknik berburu dan diet daging segar, tengkorak dan bentuk tubuh dingo dan harimau Tasmania menjadi sangat mirip.
Bekerja dengan Christy Hipsley dari Museum Victoria, tim menganalisis karakteristik tengkorak harimau Tasmania - seperti mata, rahang, dan bentuk moncong. Hipsley berkata:
Kami menemukan harimau Tasmania memiliki bentuk tengkorak yang lebih mirip dengan rubah merah dan serigala abu-abu daripada saudara terdekatnya.
Fakta bahwa kelompok-kelompok ini tidak memiliki nenek moyang yang sama sejak zaman Jurassic menjadikan ini contoh yang menakjubkan tentang konvergensi antara spesies yang saling berjauhan.
Andrew Pask menambahkan bahwa harimau Tasmania tampak hampir seperti dingo dengan kantong. Dia berkata:
Ketika kami melihat dasar untuk evolusi konvergen ini, kami menemukan bahwa sebenarnya bukan gen yang menghasilkan tengkorak dan bentuk tubuh yang sama, tetapi wilayah kontrol di sekitar mereka yang menghidupkan dan mematikan gen pada berbagai tahap pertumbuhan.
Ini mengungkapkan pemahaman baru tentang proses evolusi. Kita sekarang dapat menjelajahi wilayah genom ini untuk membantu memahami bagaimana dua spesies bertemu pada penampilan yang sama, dan bagaimana proses evolusi bekerja.
Dalam hal ini, tampaknya kebutuhan untuk berburu membuat harimau Tasmania mengubah penampilannya menjadi mirip dengan serigala selama 160 juta tahun terakhir.
Para ilmuwan sekarang dapat mulai memahami genetika yang telah mendorong proses ini dan mengungkap lebih banyak tentang biologi predator marsupial apex yang unik ini.
Tim peneliti juga termasuk ilmuwan dari University of Munster, Museums Victoria, University of Adelaide dan University of Connecticut. Beberapa pekerjaan didanai oleh Research @ Melbourne Accelerator Programme.
Spesimen C5757, 'kantong muda' digunakan untuk mengurutkan genom harimau Tasmania.
Intinya: Para ilmuwan di University of Melbourne dan di tempat lain bekerja dengan spesimen langka harimau Tasmania atau harimau Tasmania untuk mendapatkan apa yang mereka katakan adalah "genom paling lengkap untuk spesies yang punah." Ini menunjukkan harimau memiliki kesehatan genetik yang buruk, atau keragaman genetik yang rendah, dan mungkin telah berjuang untuk bertahan hidup jika tidak diburu secara berlebihan.